SCBT 401 Bioinformatics

June 6, 2015 web_admin

Academic Year 2021

เนื่องจากสถานการณ์โควิด-19 ทำให้การเรียนการสอนวิชานี้ในหัวข้อ Phylogenetic Tree ต้องเป็นแบบออนไลน์ทั้งหมด แต่ก็ยังสามารถจัดการให้นักศึกษาสามารเข้าเรียนและทำงานที่ได้รับมอบหมายซึ่งใช้โปรแกรมที่อยู่บนอินเตอร์เน็ตได้ โดยในงานที่มอบหมายชิ้นที่ 2 มีหัวข้อที่นักศึกษาเลือกมาศึกษาโดยใช้วิธีตรวจสอบสมมติฐานด้วย phylogenetic tree ดังนี้

IDNo:	Assignment 2 Title
6105068	Are Shrimp and Mantis Shrimp Related?
6105106	ปลาฉลามขาวและปลาฉลามวาฬมีความใกล้ชิดกันทางวิวัฒนาการหรือไม่
6105150	Are Siberian Cat and Siberian Dog Related?
6105303	Variation of SARS-CoV-2 Spike Protein
6105001	How is the Relationship between Butterfly and Moth?
6105003	The Relationship of Prolactin Proteins between Human and Household Pets
6105025	How are the Relationship between Alpaca and Lama?
6105033	How Close are Lions and Tigers?
6105034	Did Domestic Cats Evolve from Tigers or Lions?
6105044	Myoglobin Phylogenetic Tree
6105050	How are the Relationship of Anthocyanin-Rich Fruits?
6105053	ความสัมพันธ์ของโปรตีน Insulin Receptor ระหว่างปลาช่อนเหนือ (Chana argus) กับมนุษย์ (Homo sapiens)
6105065	Are Fly and Mosquito Closely Related?
6105074	Echinochloa crussgalli และ Oryza sativa มีบรรพบุรุษร่วมกันหรือไม่
6105081	How are the Relationship between Human and Zebrafish?
6105086	How are the Relationship between Wolf and Red Fox?
6105091	Is There a Relationship between Nitric Oxide Synthase (NOS2) Gene in Humand and House Mouse?
6105105	ความสัมพันธ์ระหว่าง Saccharomyces cerevisiae กับ Zygosaccharomyces rouxii ที่ใช้เป็นหัวเชื้อสำหรับหมักซีอิ๊วในขั้นตอน Moromi Fermentation
6105109	What are the Relationships of Luciferase Alpha Subunit Protein among Different Bacteria?
6105110	Are Penicilium roqueforti and Mucor racemosus Closely Related?
6105123	ความสัมพันธ์ของยีน APOE ในสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมกับสัตว์น้ำ
6105130	Whose ARL4 Gene is Most Related with Cow?
6105158	Are Pichia pastoris and Saccharamyces cerevisiae Closely Related?
6105163	How was the Relationship between Animals in Phylum Cnidaria?
6105164	ทำสุนัขกับแมวโดยทั่วไปจึงมีขนาดตัวต่างกัน
6105189	Which Gram-Negative Bacteria have Transcriptonal Regulator AraC Most Similar to Pseudomonas aeruginosa?
6105191	Is Blue Whale related to Pink Dolphin?
6105196	How Related between Jujube and Asian Pear?
6105298	ความสัมพันธ์ของสุนัข (Canis lupus familiaris) กับโลมาครีบขาวในแง่ของความแสนรู้ ความเฉลี่ยวฉลาด

Academic Year 2020-2021

เนื่องจากสถานการณ์การระบาดของโรค COVID-19 ทำให้การเรียนการสอนในรายวิชา SCBT401 ในปีนี้ เพิ่มช่องทางการเรียนการสอนผ่าน Google Classroom ให้นักศึกษาได้เข้าถึงเอกสารประกอบการสอน การทำงานที่ได้รับมอบหมายกันอย่างเป็นระบบ แต่เนื่องจากมีนักศึกษาจำนวนไม่มาก จึงให้มาเรียนได้ในห้องคอมพิวเตอร์ที่จัดให้ด้วยมาตรการป้องกันการติดต่อของโรคในระดับที่ควรจะเป็น

ภาพตัวอย่างการส่งงานผ่านระบบ Google Classroom

งานชิ้นที่ 1 อธิบายองค์ประกอบของ phylogenetic tree

งานชิ้นที่ 2 ทดสอบสมมติฐานและตอบปัญหาทางวิทยาศาสตร์ด้วย phylogenetic tree

หัวข้อโครงงานในงานชิ้นที่ 2 (ให้เวลาทำ 1 สัปดาห์)

(…)

Academic Year 2019-2020

ปีการศึกษา 2562-2563

เอกสารประกอบการสอน

Phylogenetics (อ.ณัฐพล)
Phylogenetic Laboratory (อ.ณัฐพล)

ข้อมูลการส่งงานที่ได้รับมอบหมาย (assignment)

ชื่อ-สกุล นักศึกษา	Assignment 1	Assignment 2	หัวข้องานวิจัยย่อย
นายจิรโชติ กรัณยากรณ์	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว	Phylogenetic relation ship of centipede genus Scolopendra in South east asia
น.ส.ชนนิกานต์ เจริญพานิช	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว	Whose HUB1 is most related with Magnaporthe oryzae?
น.ส.ชนิดา ลิ้มธรรมประเสริฐ	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว	ยุงลายบ้านและยุงลายสวน มีความใกล้ชิดทางวิวัฒนาการกันมากเพียงใด
น.ส.วลีพร แซ่ตั๊ง	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว	The Evolutionary Relationship of Gnawing Mammals
นายสิรวิชญ์ นาสารี	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว	Should human have a closer relationship with apes than monkeys?
น.ส.อริสรา ทับทิมย้อย	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว	How are the relationship among green pit viper snakes?
น.ส.พสุนันทน์ รัตนรุ่งโรจน์	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว	ความสัมพันธ์ระหว่างแมวดาวกับเสือปลาเป็นอย่างไร
น.ส.กนกวรรณ มีนธนานันท์	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว	Are Influenza A virus closely related?
นายกฤษฏิ์ ประชุมดี	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว	How are the relationship between elephant and tapir?
น.ส.จันทกานติ์ สุขเกษม	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว	Are yeast and algae relative?
น.ส.พัชรินทร์ วงศ์พาสุข	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว	Are mungbeans and cashews closely related?
น.ส.ระพีพรรณ ดวงจันทร์โชติ	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว	Are Sheep and Goat Related?
น.ส.สิริธัช ภมรสูต	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว	How closely between Zebra – Okapi – Giraffe?
น.ส.สุพิชชา จิระวิชชเลิศ	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว	Are mantis shrimp closely relate to shrimps, prawns, lobsters or crabs?
น.ส.อรนิภา ปะวะโน	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว	How closely relate between rate and mice
น.ส.ณัฐนิช เด่นไชยรัตน์	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว	How relationship of 18s rRNA sequence in Saccharomyces spp?
น.ส.ณัฐสุดา ชัยมุสิก	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว	Are hippopotamus and rhinoceros closely related?
นายอัครพงษ์ เปล่งพานิช	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว	How are relationship between Salmonella spp. and Escherichia coli?

Credit 2-3-5

Academic Year 2018-2019

Course Syllabus 2018 (PDF)

เอกสารประกอบการสอน

อ.ดร.ณัฐพล อ่อนปาน

เอกสารประกอบการสอนเรื่อง Phylogenetics (PDF)

เอกสารประกอบการสอนเรื่อง Phylogenetic Laboratory (PDF)

Assignments (20 pts as final exam score)

1 Phylogenetic Anatomy (10 pts)
2 Mini Project in Phylogenetics (10 pts)

นักศึกษา 2561

ที่	ชื่อ-สกุล	Assignment 1	Assignment 2	Project Title
1	น.ส. กุลธีรา ธนพิรุณธร	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว	สิ่งมีชีวิตในไฟลัมเดียวกัน มีลักษณะทางกายภาพและแหล่งที่อยู่คล้ายกัน จะมีความใกล้ชิดทางสายพันธุ์มากกว่าสิ่งมีชีวิตที่มีลักษณะต่างกันแต่อยู่ในไฟลัมเดียวกันหรือไม่
2	น.ส. ชนัญญา ตันสถาพร	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว	Are Blue Whales and Dugong closely related?
3	น.ส. ธนัตดา พรหมโหร	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว	How close are we to the monkeys?
4	น.ส. เบวรินทร์ แตงเทศ	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว	Are ants and bees related?
5	น.ส. ปัญญดา โถวเจริญ	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว	Are Fox and Dog closely related?
6	น.ส. ภัทรมน ไกรสมเด็จ	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว	How relationship of TP53 gene in different animals?
7	น.ส. ภูริชญา เวชโช	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว	Are fish in the sea closely related?
8	น.ส. รำไพ สิทธิคง	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว	Dehydrin Gene ในมันสำปะหลังเหมือนในมันฝรั่ง ข้าวโพด ข้าวและยางพาราหรือไม่??
9	น.ส. ลลิตา จันทร์เทียน	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว	Annexin gene ใน Arabidopsis เหมือนกับในมันสำปะหลังหรือไม่?
10	น.ส. สุภาวดี จันทสุวรรณ	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว	เห็ดหอมกับเห็ดนางฟ้า มีความใกล้เคียงกันหรือไม่ ?
11	นาย ชณภัส สิปปอักษร	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว	How closely common ancestor of Kangaroo, Koala and Sloth?
12	น.ส. ฐิตาพร ตรีวรเวทย์	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว	How relationships of living organisms in mammal species (phylogenetic tree of Heme Oxygenase Gene (Hmox1))
13	น.ส. ฑิฆัมพร คงคา	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว	หมีแพนด้าเป็นสัตว์นักล่าเช่นเดียวกับหมีสีน้ำตาลและหมีขั้วโลกหรือไม่
14	น.ส. ณัฐธยาน์ บุญมาก	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว	นกกับไก่มีความสัมพันธ์อย่างไร
15	น.ส. บุษกร เดชาพิทักษ์	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว	What are the relationships of anti-mirobial protein gene (Amp gene) in different plants?
16	น.ส. ปิยธิดา วัฒนศิริ	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว	How are the relationship of Leptospira species?
17	น.ส. ศรพรพรรณ์ ไพเราะ	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว	How are relationship of each Bactrocera species?
18	น.ส. สุธาสินี คณิตจินดา	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว	Are tardigrade and crustacean closely related?
19	นาย อภิสิทธิ์ เนรมิตธนกุล	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว	How related between frog and toad?

Academic Year 2017-2018

Lecture: Thursday 1330-1530

Laboratory: Friday 1330-1630

Venue: P114

Course Co-ordinator: Assoc. Prof. Dr. Jarunya Narangajavana

Course Syllabus (PDF)
Lecture 15 Phylogenetics
- Lecture: Phylogenetics (Color PDF)
- Laboratory: Phylogenetics Assignment

ที่	เลขประจำตัว	คำหน้าชื่อ	ชื่อ-สกุล	Assignment 1	Assignment 2
1	5605262	นาย	สิทธิพงศ์ วงษ์วาน	Drop	Drop
2	5705018	น.ส.	กุลย์ฤญาณี ทองหัวไผ่	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว
3	5705021	นาย	คณวรรษ สุวรรณประเสริฐ	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว
4	5705024	น.ส.	จณิสตา ธำรงธราดล	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว
5	5705041	น.ส.	ชุลิตา นวกุล	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว
6	5705066	น.ส.	ณิชา ทองขาวเผือก	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว
7	5705085	นาย	ธัญวิชญ์ ธรรมชัย	ส่่งแล้ว	ส่่งแล้ว
8	5705135	น.ส.	พิมพ์มาดา หัตถการกุล	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว
9	5705145	น.ส.	ภาวิตา ทายพงศ์ศักดิ์	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว
10	5705156	น.ส.	รมิตา พุทธา	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว
11	5705161	น.ส.	ลลิตา วิไลเอก	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว
12	5705177	น.ส.	ศมน มิตรเอม	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว
13	5705195	น.ส.	สิตารัตน์ คะณา	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว
14	5705229	นาย	ฉัตรชัย อนงค์พรยศกุล	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว
15	5705248	น.ส.	ปนัดดา พิลึก	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว
16	5705254	น.ส.	พลอยชมพู อยู่สบาย	ส่่งแล้ว	ส่งแล้ว
17	5705124	นาย	พศวีร์ ประเสริฐสุข	ส่งแล้ว	ส่งแล้ว