แบบทดสอบพื้นฐานเรื่อง Phylogeneny

ข้อใดต่อไปนี้ใช้สร้าง phylogeny ได้

ข้อใตต่อไปนี้เหมาะสมที่สุดสำหรับศึกษาความสัมพันธ์ทางวิวัฒนาการในช่วงเวลาประมาณหนึ่งร้อยล้านปีที่ผ่านมา

ยีนบนโครโมโซมของแต่ละสปีชีส์จัดเรียงกันดังนี้ สปีชีส์ ก: adebcfg ข: abcdefg และ ค: abedcfg ข้อถูกต้องที่สุดเกี่ยวกับความสัมพันธ์ของสปีชีส์เหล่านี้

จงเติมขั้นตอนที่เว้นไว้ของการสร้าง phylogenetic tree ต่อไปนี้

1.  เลือกลำดับเบสหรือโปรตีนที่สนใจ
2. หาลำดับเบสหรือโปรตีนอื่นที่สัมพันธ์กันจากแหล่งข้อมูลต่างๆ
3. ???
4. สร้าง phylogenetic tree
5. นำเสนอ phylogenetic tree ที่สร้างได้

เมื่อค้นหาฐานข้อมูลเช่นของ GenBank ด้วยลำดับเบสที่สนใจ ค่า bit score และ E value ของ sequence ที่จะเลือกใช้ควรมีค่าเป็นอย่างไรตามลำดับ

ข้อใดต่อไปนี้สอดคล้องกับการที่ผมรวมของ branch length ระหว่าง node มีค่าเท่ากับความแตกต่างจริงๆระหว่าง node เหล่านั้น

ข้อใดเกี่ยวข้องกับ topology ของ phylogenetic tree

ข้อใดเกี่ยวข้องกับ phylogenetic tree ที่ต้องการเปลี่ยนแปลงน้อยที่สุดของ sequence

Convergent evolution และ parallelism เกี่ยวข้องกับข้อใดมากที่สุด

สปีชีส์ที่มีความสัมพันธ์ทางวิวัฒนาการใกล้ชิดกับ กลุ่มสปีชีส์ที่เราสนใจศึกษาอยู่ เกี่ยวข้องกับข้อใดมากที่สุด